隐藏着许多神秘地点等待大家去发现，这些地方往往藏着稀有资源、特殊剧情或者有趣的彩蛋。比如秘密森林，它位于农场南部的煤矿森林西北角，需要升级钢斧才能劈开挡路的巨木进入。每天这里会刷新6个大树桩，能收集12个硬木，是硬木的重要来源之一。如果选择非森林农场开局，这里还是唯一能钓到木跃鱼的地方。森林内部还有隐藏通道和池塘，探索起来充满惊喜。
另一个神秘地点是女巫沼泽，进入需要先完成黑暗护符任务并携带虚空蛋黄酱。第一次到达时会被仆人拦住，交出虚空蛋黄酱后就能进入神秘小屋见到法师。这里与主线剧情和某些特殊事件相关，比如女巫可能会飞过鸡舍留下虚空蛋。沼泽区域充满紫色雾气，氛围独特，是游戏中最具魔幻色彩的区域之一。
姜岛则是1.5版本新增的大型隐藏区域，需要通过完成社区中心或Joja仓库任务后修复威利的旧船前往。岛上包含火山地牢、丛林金核桃谜题和海盗湾等丰富内容。火山地牢有10层，能获取稀有矿石和锻造装备；丛林里散落的金核桃可解锁新区域和功能；而海盗湾的小游戏能赚取额外奖励。姜岛的设计让后期玩法更加多样，值得慢慢探索。
下水道的隐藏路径也很有趣，除了科罗布斯的商店外，另一个洞口需要解锁后才能进入。这里能遇到游戏唯一的友好怪物科罗布斯，还能用宝石兑换特殊物品。冬季在这里触发冬日谜团任务，跟随脚印找到科罗布斯可获得放大镜，之后就能解读秘密纸条了。这些纸条会提示隐藏宝藏或NPC的小秘密，收集全25张能更深入了解星露谷的幕后故事。
最后别忘了夜市期间的特殊深海区域，冬季15-17日乘潜艇可钓到三种专属鱼类。美人鱼表演时按15423的顺序敲击贝壳能获得珍珠，这是送礼或出售的珍贵物品。夜市的设计充满童话感，潜艇探险和海底景观也让人眼前一亮。这些神秘地点串联起游戏的隐藏脉络，让每一次探索都像拆开礼物一样充满期待。
